生物安全柜分為Ⅰ級、Ⅱ級和Ⅲ級，用于不同程度的生物安全等級的環境使用。

Ⅰ級生物安全柜Ⅰ級生物安全柜能保護環境和人員避免受生物的侵害，但不能保護產品免受污染。該生物安全柜本身沒有動力風機，主要是通過外接通風管中的風機帶動氣流，不能有效地保護安全柜內實驗樣品，目前國內已很少使用。

Ⅱ級生物安全柜Ⅱ級生物安全柜既能保護實驗樣品，同時還能保護實驗室人員和周圍環境。因此，它是目前國內市場上應用較為廣泛的生物安全柜。根據安全柜的排風循環的方式和入口處氣流速度，Ⅱ級生物安全柜可分為 A1、A2、B1、B2 四個型號。

1）A1 型安全柜空氣通過安全柜工作臺前窗口吸入，國家校準規范中要求最小的平均風速應不低于 0.38 m/s，經過高效過濾器處理后，氣流向下流動，大部分氣體是過濾的原有循環氣體，有一小部分是通過過濾器新吸入的補充氣體。原有的循環氣體有一小部分通過排氣口高效過濾器過濾排放到實驗室內。Ⅱ級生物安全柜 A1 型適用于國內非常熟知的并且容易控制的病原體，該病源不會大范圍引發健康成人類疾病，對周圍環境和操作人員存在較小的危險。

2）A2 型安全柜空氣通過安全柜工作臺前窗口吸入，國家校準規范中要求最小的平均風速應不低于 0.51 m/s，經過高效過濾器處理后，氣流向下流動，大部分氣體是過濾的原有循環氣體，有一小部分氣體是通過過濾器新吸入的補充氣體。原有的循環氣體有一小部分通過排氣口高效過濾器過濾排放到室外，不再返回實驗室內。Ⅱ級生物安全柜 A2 型適用于對試驗人員和周圍環境有中度潛在危險的病原體。